Willkommen

Willkommen auf meiner Internetseite!

Seit mehr als 20 Jahren berate ich Studierende, Wissenschaftler:innen und Firmen bei jeglicher Art von statistischen Fragen und bin immer an neuen Projekten interessiert. Falls Sie bei einer neuen Projektidee  oder einem bestehenden Projekt statistische Unterstützung benötigen, nehmen Sie doch Kontakt via E-Mail mit mir auf.

Welcome to my website!

For more than 20 years I have been advising students, scientists and companies on all kinds of statistical questions and I am always interested in new projects. If you need statistical support for a new project idea or an existing project, please contact me via email.

Beratung

Statistische Beratung

Statistische Beratung biete ich sowohl in meiner Funktion als Professor für Mathematik in Biologie und Medizin und als Leiter der Forschungsgruppe „Data Science for Life Science“ am  Institute of Precision Medicine an der Hochschule Furtwangen (primär Förderprojekte) als auch als Leiter des Steinbeis-Transferzentrums Personalisierte Medizin an (primär für Unternehmen).

Idealerweise sollte man mich als Statistiker bereits nach der Festlegung der (primären und sekundären) Fragestellung(en) bzw. der Problemstellung hinzuziehen. Ich kann Sie dann bei allen weiteren Schritten wie

  • Festlegung des Studiendesigns
  • Auswahl geeigneter wahrscheinlichkeitstheoretischer Modelle
  • Fallzahlplanung und Poweranalyse
  • Monte-Carlo Simulationen
  • Datenerhebung und vor allem Speicherung in einer Form, welche die statistische Analyse vereinfacht
  • Statistische Analyse
  • Bioinformatische Analyse
  • Bildanalyse
  • Statistische / Maschinelles Lernen
  • Graphische Darstellungen
  • Interpretation
  • Publikation

unterstützen.

In den allermeisten Fällen arbeite ich mit der Statistiksoftware R, die mir nahezu uneingeschränkte Möglichkeiten der statistischen Analyse ermöglicht und die ich durch eigene Funktionen und Pakete jederzeit selbst erweitern und an die Anforderungen eines Projektes anpassen kann.

Ich biete auch Unterstützung bei der Entwicklung von R Paketen (siehe http://www.r-project.de/) sowie einführende oder vertiefende Schulungen für die Statistiksoftware R (siehe http://www.r-kurse.de/) an.

Die Ergebnisse meiner Arbeit fasse ich im Sinne einer reproduzierbaren Forschung mit Hilfe von Rmarkdown oder knitr und LaTeX in einem umfassenden Bericht zusammen, der neben meiner Analyse (R Code) auch die graphischen Darstellungen sowie meine Interpretationen enthält.

Projekte

Ausgewählte aktuelle Projekte

  • Development of hybrid plastic sorbents based on a sorption database (HyPlastDB)
    gefördert durch invest BW
  • Transkriptom-Analyse des Metabolismus von FSHD Mitochondrien unter Berücksichtigung einer asymmetrischen Muskelbeteiligung zur Identifikation neuer potenzieller Therapieansätze
    gefördert durch Deutsche Gesellschaft für Muskelkranke (e.V.)
  • Muskelverspannungen messen?
    gefördert durch Innovative Projekte MWK Baden-Württemberg

Softwareprojekte

Ausgewählte abgeschlossene Projekte

Einen Überblick über viele meiner Projekte geben auch meine Publikationen.

  • Funktionelle Lateral-Flow Arrays zur Identifizierung multiresistenter Keime (FlowArray)
    gefördert durch BMBF (FHprofUnt)
  • Mikroresonatoren für die point-of-care Diagnostik pathogener Keime (InfektResonator)
    gefördert durch BMWE
  • Translation klinischer Marker für Sauerstoffmangel bei Neugeborenen in ein neues Diagnostikum zur Vermeidung frühkindlicher Hirnschäden und Steuerung einer individualisierten Therapie (AsphyxDx)
    gefördert durch Forum Gesundheitsstandort BW
  • Therapiebegleitende Diagnostik zur Verbesserung des Therapieerfolgs der therapeutischen Hypothermie bei perinataler hypoxisch ischämischer Enzephalopathie (CompanionDx Hypothermie)
    gefördert durch BMBF
  • Multiplex Lateral-Flow Assays für die Personalisierte Medizin (MultiFlow)
    gefördert durch BMBF (FHprofUnt)
  • In-Vitro Translation Organtoxischer Metabolischer Biomarker des Leberversagens aus klinischem und experimentellen Probenmaterial
    gefördert durch BfR
  • InterSept – POC Analytik für Interventionsstudien zur personalisierten intensivmedizinischen Behandlung von Sepsispatienten
    gefördert durch BMBF
  • Wirkeffekte alternativer Trainingstechnologien auf chronische Rückenschmerzen bei Rückenschmerzpatienten unter besonderer Berücksichtigung deren Nachhaltigkeit
    gefördert durch DFG
  • Patientenspezifische klinische Entscheidungsunterstützungssysteme für Organversagen (PATIENTS)
    gefördert durch BMBF (FHprofUnt)
  • Robust Risk Estimation
    gefördert durch VolkswagenStiftung
  • FastDiagnosis – Point of care Sepsisdiagnostik durch spektroskopische Pathogenidentifizierung und multiplex – Nachweis von Biomarkern
    gefördert durch BMBF
  • ARGES – age-dependent inflammatory responses after stroke
    gefördert im Rahmen von FP6-2004-LIFESCIHEALTH-5 (EU).
  • MAQC-II – Microarray Quality Control (phase II)
    Mitglied der Regulatory Biostatistics Working Group (RBWG)
    gefördert durch FDA

Publikationen

Publikationen

eine vollständige Liste meiner Publikationen finden Sie unter meinen Profilen auf Google Scholar und ResearchGate  sowie etwas eingeschränkter auf ORCID und Scopus.

Bücher

  1. M. Kohl. Einführung in die statistische Datenanalyse mit R. 2. Auflage, 2022, 313 Seiten, Selbstverlag, kostenlos.
  2. M. Kohl. Introduction to statistical data analysis with R. 2nd edition, 2022, 300 pages, Self-publishing, free.
  3. H.P. Deigner, M. Kohl. Precision Medicine: Tools and Quantitative Approaches. 1st Edition, 2018, 374 pages. eBook ISBN: 9780128054338, Paperback ISBN: 9780128053645.
  4. M. Kohl. Einführung in das Programmieren mit R. 1. Auflage, 2016, 278 Seiten, kostenlos. ISBN: 978-87-403-1235-5.
    R Code aus dem Buch; R Code in Form von R markdown Dateien
  5. M. Kohl. Einführung in die statistische Datenanalyse mit R. 1. Auflage, 2015, 239 Seiten, kostenlos. ISBN: 978-87-403-1156-3.
    ITS Datensatz; R Code aus dem Buch; R Code in Form von R markdown Dateien; Ergänzung zum Buch: Which Statistical Test?
  6. M. Kohl. Introduction to statistical data analysis with R. 1st edition, 2015, 228 pages, free. ISBN: 978-87-403-1123-5.
    ICU Datensatz; R Code aus dem Buch; R Code in Form von R markdown Dateien; Ergänzung zum Buch: Which Statistical Test?
  7. M. Kohl. Analyse von Genexpressionsdaten – mit R und Bioconductor. 1. Auflage, 2013, 197 Seiten, kostenlos.  ISBN: 978-87-403-0349-0.
    R Code aus dem Buch
  8. Dissertation: „Numerical Contributions to the Asymptotic Theory of Robustness“ (2005) [14.9 MB]
    1. Gutachter und Betreuer: Prof. Dr. H. Rieder,
    2. Gutachter: Prof. Dr. S. Morgenthaler
    Offizielle Version: https://epub.uni-bayreuth.de/839/

Unveröffentlichte Manuskripte

  1. M. Kohl.  „Asymptotic Theory of Robustness – a short summary“. Technical Report 2005, University of Bayreuth.
  2. M. Kohl.  „Installation und erste Schritte mit R“. Technical Report 2011, Furtwangen University.
  3. P. Ruckdeschel and M. Kohl. „R/S-Plus für Einsteiger und Fortgeschrittene„. Slides, University of Bayreuth.
  4. P. Ruckdeschel and M. Kohl. „Computation of the Finite Sample Risk of M-estimators on Neighborhoods„. Unpublished manuscript.

Software

R und Bioconductor Pakete

  1. M. Kohl. R-package „rmx: Radius-Minimax Estimators“, 2022.
  2. F. Paskali, W. Schary, and M. Kohl. R-package „LFApp: Shiny Apps for Lateral Flow Assays“. CRAN since 07/2021.
  3. M. Kohl. R-package „MultiFlow: Multiplex Lateral Flow Assays“, 2020.
  4. M. Kohl. R-Package „MKclass: Statistical Classification“. CRAN seit 10/2020.
  5. M. Kohl. R-Package „MKomics: Omics Data Analysis“. CRAN seit 02/2020.
  6. M. Kohl. R-Package „MKpower: Power Analysis and Sample Size Calculation“. CRAN seit 02/2020.
  7. M. Kohl. R-Package „MKinfer: Inferential Statistics“. CRAN seit 12/2019.
  8. M. Kohl. R-Package „MKdescr: Descriptive Statistics“. CRAN seit 11/2019.
  9. P.  Ruckdeschel,  M. Kohl, N. Horbenko.  R-Package „RobExtremes: Optimally Robust Estimation for Extreme Value Distributions“. Contributions by S. Desmettre, G. Kroisandt, E. Massini, D. Pupashenko and B. Spangl. CRAN seit 08/2018.
  10. P. Ruckdeschel, M. Kohl  R-Package „RobAStRDA: Interpolation Grids for Packages of the ‚RobASt‘ – Family of Packages“. Contributions by S. Desmettre, G. Kroisandt, E. Massini, D. Pupashenko, M. Pupashenko, and B. Spangl. CRAN seit 08/2018.
  11. S. Kolampally, M. Kohl. R-Package „mpe: Multiple Primary Endpoints“. CRAN seit 02/2017.
  12. N. Horbenko, M. Kohl, D. Pupashenko, M. Pupashenko, P. Ruckdeschel. R-Package „distrRmetrics: Package distr classes for distributions from Rmetrics“. CRAN seit 02/2013.
  13. J. Perkins, M. Kohl. Bioconductor-Package „NormqPCR: Functions for normalisation of RT-qPCR data“. Bioconductor seit 07/2011.
  14. J. Perkins, M. Kohl. Bioconductor-Package „ReadqPCR: Read qPCR data“. Bioconductor seit 07/2011.
  15. F. Flessa, A. Kehl, M. Kohl. R-Package „RFLPtools: Tools to analyse RFLP data“. CRAN seit 02/2010.
  16. M. Kohl. R-Package „RobLoxBioC: Infinitesimally robust estimators for preprocessing omics data“. CRAN seit 11/2009.
  17. M. Kohl, P. Ruckdeschel, M. Pupashenko, G. Kroisandt. R-Package „RobAStBase: Robust Asymptotic Statistics“. CRAN seit 09/2008.
  18. P. Ruckdeschel, M. Kohl. R-Package „distrMod: Object orientated implementation of probability models“. CRAN seit 09/2008.
  19. P. Ruckdeschel, M. Kohl, A. Hueller, E. Feist. R-Package „distrTeach: Extensions of package distr for teaching Stochastics/Statistics in secondary school“. CRAN seit 09/2008.
  20. M. Kohl. R-Package „MKmisc: Miscellaneous Functions from M. Kohl „.
    CRAN seit 09/2008.
  21. M. Kohl. R-Package „RobRex: Optimally robust influence curves for regression and scale“. CRAN seit 08/2007.
  22. M. Kohl, P. Ruckdeschel. R-Package „ROptRegTS: Optimally robust estimation for regression-type models“. CRAN seit 08/2007.
  23. M. Kohl, P. Ruckdeschel. R-Package „RobLox: Optimally robust influence curves for location and scale“. CRAN seit 08/2007.
  24. M. Kohl, P. Ruckdeschel, M. Pupashenko, G. Kroisandt. R-Package „ROptEst: Optimally robust estimation using S4 classes and methods“. CRAN seit 08/2007.
  25. M. Kohl. Bioconductor-Package „SLqPCR: Functions for analysis of real-time quantitative PCR data at SIRS-Lab GmbH“. Bioconductor seit 01/2007.
  26. M. Kohl. R-Package „SLmisc: Miscellaneous Functions for analysis of gene expression data at SIRS-Lab GmbH“. CRAN von 01/2007 bis 08/2009 (jetzt CRAN Archiv).
  27. P. Ruckdeschel, M. Kohl, T. Stabla, F. Camphausen. R-Package „distrDoc: Documentation for packages distr, distrEx, distrSim, distrTEst, distrTeach, and distrMod“. CRAN seit 11/2006.
  28. M. Kohl, P. Ruckdeschel. R-Package „RandVar: Implementation of random variables“. CRAN seit 10/2005.
  29. M. Kohl, P. Ruckdeschel. R-Package „distrEx: Extensions of package distr“. CRAN seit 10/2005.
  30. P. Ruckdeschel, M. Kohl, T. Stabla, F. Camphausen. R-Package „distrTEst: Estimation and Testing classes based on package distr“. CRAN seit 10/2005.
  31. P. Ruckdeschel, M. Kohl, T. Stabla, F. Camphausen. R-Package „distrSim: Simulation classes based on package distr“. CRAN seit 10/2005.
  32. P. Ruckdeschel, M. Kohl, T. Stabla, F. Camphausen. R-Package „distr: Object orientated implementation of distributions“. CRAN seit 04/2004.

Entwickler Versionen